Руководства  по  анализу  фитосанитарного  риска  предназначены  для  использования Национальными организациями по карантину и защите растений, как органов, ответственных за установление  фитосанитарных  регламентаций  и  применение  фитосанитарных  мер  в  рамках требований  Международной  Конвенции  по  карантину  и  защите  растений,  МСФМ  №  1 («Фитосанитарные принципы карантина и защиты растений и применение фитосанитарных мер в международной торговле») и МСФМ № 2 («Структура анализа фитосанитарного риска»). Эти руководства также используются техническими органами ЕОКЗР для разработки рекомендаций по фитосанитарным мерам для Национальных организаций по карантину и защите растений.